SpartanModelには分子力場による構造最適化機能に加えて一般的な有機分子数千件の構造を含むデータベースを内臓しています。このデータベース構造と名称で検索することができ、全てのエントリーには量子学的手法で最適化した構造を計算によって得られた各種のプロパティと静電ポテンシャルを持っています。