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計算のタスク計算可能なプロパティ | 新機能 | 価格
  Spartan のユーザインターフェイス
Spartan Student Editionは種々の機能が内臓された使いやすい単一のユーザインターフェイスを装備しています。
このインターフェイスはSpartan for Windowsの使いやすさを維持しつつ、より簡略化したものです。ご自分の分子を構築、計算を実行し、分子内の電荷分布などを可視化するなどの処理を 非常に短時間に行うことができるように設計されています。
分子ビルダーなど
  Entry sp3構造の炭素など有機化学で必ず現れるフラグメントライブラリー(パネルキット)から選択して、分子を構築します。
  Expert

周期表から原子タイプを選択して構造を入力するだけでなく、結合のタイプの修飾も可能です。リガンドなどライブラリーも有しています。

  Peptide アミノ酸残基の列の入力によりへリックス構造やシート構造などのポリペプチド鎖を入力できます。
  Nucleotide

核酸のライブラリから選択することで、DNA、RNAの一重または二重螺旋構造などの入力を可能とします。

  構造最適化

ビルダーに装備している分子力場(MMFF94)により、構築中の分子構造のリファインを行います。

  遷移構造探索

既知の遷移構造のデータベースからパターンマッチングにより類似構造をイニシャルゲスとして提供します。検索条件は電子の移動を矢印での入力によります。

  Student Spartan Moleulan Database SpartanStudentEditionには6000以上の分子ライブラリが添付しています。分子構築の途中で自動的に構造検索したり、別途専用ダイアログでトポロジー検索ができます。
登録されている情報:名称三次元構造情報・気層のエネルギー・水溶液中でのエネルギー、HOMO/LUMOのエネルギー、双極子モーメント・電荷分布・表面積・体積・分子量・対象性

グラフィックス表示
  分子モデル

分子構造の表示モードとして、単純なワイヤー表示、ボール&ワイヤー表示、チューブ表示ボール&スポーク表示、空間充填モデル表示から選択できます。

原子中心やユーザ定義による点/平面を使用した、距離、角度、二面角の計測、空間充填モデルの分子表面積と分子の体積の計測が可能です。

双極子モーメントの表示が矢印で表現できます。

  生体高分子のモデル

ポリペプチド/ポリヌクレオチドはリボン表示し、二次構造や残基の種別による色分けも可能です。

  サーフェスとマップ

全電子密度、スピン密度、分子軌道、静電ポテンシャル、およびイオン化ポテンシャルについては分子近傍における等値面を作成表示することができます。(これをサーフェスといっています)また、全電子密度面上の  分子軌道や静電ポテンシャルの分布を色分けすることも可能です。(これをマップとよんでいます)サーフェスやマップは不透明、半透明、メッシュ、ドット(点描画)による表示が可能で、特にマップの場合には、サーフェス(マップ)上の位置をクリックすることで、その場所でのプロパティ(分子軌道や静電ポテンシャル)の値を計測することが可能です。

  アニメーション表示

分子リストにおいて作成された、サーフェスやマップ(スライスも含みます)を伴った分子構造はパラパラマンガのように表示させてアニメーション表示ができます。表示はマニュアルで1コマずつの表示と自動表示(ビデオ再生ボタン)の切り替えができます。このような機能を利用して化学反応のや配座同士の動きの表現ができます。また基準振動モードを再現することで反応系から生成系までなめらかに動く反応座標を表示することも可能です。

  3次元的表示

分子モデルやサーフェス、マップなどのモデルは赤/青の色セロファンの眼鏡をかけることで立体的に見える表示モードに変更することができます。

  複数のモデル スクリーンには必要なだけ複数の分子モデルを表示でき、それぞれがサーフェスなどと同時に表示してもかまいません。また類似構造をもつ分子群は重ねあわせ機能を使って同じ立体的配置にそろえて表示することができます。

ダイアログ
  Calculations 分子の計算を設定するダイアログは簡単に選択することで、分子力場や分子軌道計算を選択実行できるようになっています。もうひとつサーフェスやマップ、スライスなどを設定するダイアログを装備しています。
  Properties エネルギー、双極子モーメント、電荷分布など、を表示します。モデル選択の有無によってダイアログの内容が変わるコンテクスト形式になっています。
  Spreadsheet

分子リストの場合には個々モデルにおけるプロパティをスプレッドシートにPOST「入力」することで2次元のグラフを作成することができます。

  Output

出力結果(アプトプットリスト)を表示します。分子リストの場合には個別の分子モデルの出力を個々のOutputダイアログで表示します。


その他のGUI機能
  ファイルのインポート/エクスポート Spartanシリーズがサポートする種々のフォーマットの他、PDB、SYBYL  Mol、Mol2、Macromodelの分子構造のフォーマットを入出力できます。
  グラフィックスファイルの出力

BMP、JPEGフォーマットによる静止画 
AVIフォーマットによるアニメーション表示(分子リスト作成時)

  コピー/ペースト 分子構造やグラフィックスのクリップボードを使用したコピー/ペーストが可能。