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モデルキット: |
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Organic
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有機化学で一般的な結合タイプをもった原子レベルのユニット(sp3の炭素原子など)、官能基、環、ライブラリーから、パーツを選びます。ライブラリーは拡張できます。 |
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Substituent |
共通の母核の一部を一般的な官能基群で置換して分子群を作ります。
官能基群のライブラリーはカスタマイズや拡張が可能です。 |
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分子構築 |
Tridentでは分子構築を使いやすいメニューやアイコンを使ってフラグメントの接続、削除、結合の生成、結合の切り離しを行います。また複数分子の入力も可能です。 |
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グラフィックス表示: |
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分子の表示 |
分子構造の表示モードとして、単純なワイヤー表示、ボール&ワイヤー表示、チューブ表示ボール&スポーク表示、空間充填モデル表示から選択できます。 |
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水素結合 |
分子間および分子内の水素結合の自動認識および表示をさせることができます。 |
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生体高分子のモデル |
ポリペプチド/ポリヌクレオチドはリボン表示やビーズ表示が可能。二次構造や残基の種別による色分けも可能です。 |
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化学特性ディスクリプター(CFD) |
Tridentでは化学特性ディスクリプターを表示することができます。
水素結合のドナー、アクセプター、正負のイオン化中心、芳香環、そして疎水性です。
これらの定義は変更可能です。 |
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