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構造/プロパティ |
Tridentでは与えた構造や最適化された構造の全エネルギー（Hartree-Fock）、生成エネルギー（PM3)を求めるために量子力学的手法を使用しています。波動方程式を解くことでいくつもの有用なデータを得ることができます。エネルギー、水の溶媒エネルギー、HOMO/LUMOのエネルギー、原子の電荷、双極子モーメントなどです。
それに加え、Tridentのプロパティ計算は分子量、分子の表面積、体積、PSA、LogP、電気陰性度など分子のディスクリプターとして使用できる数値を求めます。 |
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分子の形状 |
Tridentに装備された分子力場を用いて、配座解析を行います。
気層もしくは水溶液中における、最安定構造またはそれを含む他の安定構造群を求めます。手法はシステマティックもしくはモンテカルロを使用します。加えて、配座空間をカバーする最低限の安定配座群をから構成される配座のライブラリーを作成することも可能です。これは、分子の類似性解析をする際に特に有益に使用できます。そのほか、分子の一部に一定の拘束条件を与えた条件での構造最適化も可能です。 |
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類似性解析 |
Tridentでは分子の類似性解析をいくつかの方法で行います。
原子種、化学特性ディスクリプター（CFD)またはファーマコフォアです。 |
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