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Acknowledgements
Scope of this Guide
What's New in Spartan'04
Table of Contents
Section I
  Chapter 1
Section II
  Chapter 2
  Chapter 3
  Chapter 4
  Chapter 5
  Chapter 6
  Chapter 7
Section III
  Chapter 8
  Chapter 9
  Chapter 10
  Chapter 11
  Chapter 12
  Chapter 13
  Chapter 14
  Chapter 15
  Chapter 16
  Chapter 17
Appendix:
A B C D E F G H I



Chapter 11 - The Geometry メニュー
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この章ではGeometryメニューの機能について説明します.このメニューでは(結合長,結合角および二面角などの)構造パラメーターに対する情報,点や面の定義,構造を固定するための設定,原子中心の凍結,初期設定における結合や環の帰属の変更や配座解析におけるNOEの導入,およびリスト中の分子の整列などを行うことができます.

Geometryメニューでは選択した分子の構造に関する情報や構造パラメーターを設定するための準備を行うことができます.このメニューではまた,点や面の定義,構造を固定するための設定,配座解析のための初期設定における結合や環の帰属の変更やNOEデータの取り込み、およびリスト中の分子の整列も行うことができます.

Geometryメニューを操作するためには一つ以上の原子,結合,点,面あるいはあらかじめ定義された固定マーカーを選択する必要があります.選択するには原子,結合,固定マーカーをクリックします.原子が選択されるとその原子には金色の小さな球が表示されます.結合を選択するとその結合によってつなげられている二つの原子上に金色の小さな球が表示されます.結合距離の固定マーカーを選択すると二つの原子上に金色の球が表示され,結合角の固定マーカーを選択すると三つの原子上に金色の球が表示されます.また,二面角の固定マーカーを選択すると四つの原子上に金色の球が表示されます.